尊重客觀規律。習近平總書記強調：“要處理好尊重客觀規律和發揮主觀能動性的關系。”南水北調工程從規劃論證到建設實施，始終堅持科學比選、周密計劃，始終堅持生態優先、綠色發展，先后組織上百次國家層面會議，6000多人次專家參加論證，合理確定工程規模、總體布局和實施方案，最終實現經濟、社會、生態效益相統一。實踐證明，重大跨流域調水工程關系經濟社會發展全局，必須遵循經濟規律、自然規律、社會規律，科學審慎論證方案，重視生態環境保護，既講人定勝天，也講人水和諧。
規劃統籌引領。從提出設想到實施建設，多年來南水北調工程始終把規劃作為推進工作的重中之重。經過幾代人廣泛深入的勘測、研究、論證、比選，最終形成《南水北調工程總體規劃》，統籌長江、淮河、黃河、海河四大流域水資源情勢，兼顧各有關地區和行業需求，確定了“四橫三縱、南北調配、東西互濟”的總體格局。實踐證明，實施重大跨流域調水工程，必須加強頂層設計，優化戰略安排，充分發揮規劃的先導作用、主導作用和統籌作用。
重視節水治污。南水北調工程始終把節水、治污放在突出位置。一方面，加強節水管理，倒逼產業結構調整和轉型升級，受水區節水達到全國先進水平；另一方面，探索形成“政府主導、企業參與、社會監督、多方配合”的治污工作模式，強化東線治污和中線水源地保護。實踐證明，調水工程是生態工程、綠色工程，必須堅持先節水后調水、先治污后通水、先環保后用水，促進人與自然和諧共生。
精準調度水量。水量調度是重大調水工程運行管理的重點內容。南水北調東線、中線一期工程通水后，通過多種措施全面掌握調水區來水情況和受水區用水需求，統籌經濟社會發展和生態環境保護需要，科學編制年度水量調度計劃，根據實時水情精準調度，確保優質水資源安全送達千家萬戶、江河湖泊。實踐證明，面對工程沿線不同地域、不同受眾、不同水情、不同需求，必須細化制定水量分配方案，加強從水源到用戶的精準調度，不斷增強人民群眾的獲得感、幸福感、安全感。
